میگرن تنها به سردرد محدود نمی شود گاهی باعث ایجاد عوارض  در بیمار می گردد . این عوارض عمدتا  در کسانی که اقدام به درمان سردرد خود نمی کننند یا افرادی که فقط از مسکن استفاده می کنند دیده می شود. مهمترین عوارض در میگرن شامل موارد زیر است:

یک سوم بیماران مبتلا به میگرن درخطر ابتلا به سکته مغزی می باشند  میگرن به عنوان عامل چهارم در ایجاد سکته مغزی نقش دارد.درخانمهایی که میگرن دارند و قرص جلوگیری  از بارداری مصرف می کنند وافرادی که سیگار می کشند احتمال بروز سکته مغزی در آنها بیشتر است. میگرن مزمن باعث اختلال در خواب می شود این بیماران  درشروع خواب مشکل دارند ویا پس  ازبیدار شدن احساس نیاز به خواب دارند  .کم خوابی  ویا خوابیدن طولانی بویژه  در روزهای  تعطیل می تواند باعث تشدید سردرد می شود. میگرن می تواند  منجر به آسیب شدید عصب شنوایی شود .بیماران میگرنی دوبرابر سایر افراد در معرض کاهش ناگهانی شنوایی شود.در بیماران میگرنی اضطراب  وافسردگی   بیشتر ازافراد عادی دیده  می شود. کمردرد و دردگردن دربیماران میگرنی که درمان نمی کنند شایع تر است . تشنج در بیماران  میگرنی دوبرابر دیگران است کاهش تمرکز و حافظه  از عوارض شایع میگرن می باشد.